伊藤剛

所属機関名 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 高度解析センター ゲノム情報大規模解析チーム
肩書き チーム長
氏名 伊藤剛
連絡先(電話番号) 029-838-8948
所在都道府県名 茨城県
見える化ID 001694
URL http://rapdb.dna.affrc.go.jp/
http://tasuke.dna.affrc.go.jp/
https://galaxy.dna.affrc.go.jp/
カテゴリ 水稲 品種

研究情報

2014年度   Development of transcriptome shotgun assembly-derived markers in bunching onion (Allium fistulosum)

2014年度   Transcriptome analysis of barley identifies heat shock and HD-Zip I transcription factors up-regulated in response to multiple abiotic stresses

2013年度   bex-db:Bioinformatics workbench for comprehensive analysis of barley-expressed genes

2012年度   ジーンターゲッティングイネにおける“ゲノムのきれいさ”の証明

2012年度   画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベース 3 共通開発基盤の構築

2012年度   次世代型シーケンサーから得られた塩基配列を用いた効率的な変異検出系の開発. II. F2分離集団の場合

2012年度   RNA-Seq法による感染時のイネといもち病菌同時遺伝子発現プロファイル解析

2012年度   ゲノムワイドな系統解析によるイネ栽培史における遺伝子移入パターンの解明

2012年度   オオムギ発現データベース: bex-db

2012年度   ソルガムの紫斑点病感染で発現誘導される遺伝子群の解析

2012年度   RNA-Seq法によるカドミウムストレス応答に関わるイネトランスクリプトーム解析

2012年度   次世代型シーケンサーから得られた塩基配列を用いた効率的な変異検出系の開発

2012年度   画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベース2解析共通基盤の構築

2012年度   ISBP (Insertion Site Based Polymorphism) を用いたコムギ6B染色体特異的マーカー開発と評価

2012年度   画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備

2012年度   農作物改良のためのゲノムリソースとデータベース

2012年度   SogoDB - 画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備について

2011年度   イネレトロ遺伝子の網羅的発現解析

2011年度   新規シトクロムP450遺伝子CYP72A31はイネにおける除草剤ビスピリバックナトリウム耐性に関与する

2011年度   オオムギ品種「はるな二条」由来の24、783完全長cDNA配列とデータベースの公開

2011年度   イネゲノムのアノテーション情報がない領域から塩ストレスで発現誘導されるRNAの網羅的同定と機能予測

2011年度   ソルガムのアノテーション情報がない領域から紫斑点病感染で発現誘導される遺伝子の同定

2011年度   mRNA-Seq法によるリン酸欠乏及びリン酸過剰ストレス処理で応答するイネ転写産物の同定

2011年度   mRNA-Seq法によるリン酸欠乏及びリン酸過剰ストレス応答にかかわるイネのトランスクリプトーム解析

2011年度   リン酸欠乏ストレス条件下におけるイネ品種間の比較トランスクリプトーム解析

2011年度   「画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベース」の試み

2011年度   イネの新たな高精度版ゲノムとRAP-DB

2011年度   日本型イネとインド型イネの分岐時間の推定

2011年度   アジアイネ栽培系統の独立な栽培化と交雑過程の解明

2011年度   オオムギ完全長cDNA 24,783 配列をデータベースから公開

2011年度   画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベース 1 総合DB・ブラウザについて

2011年度   画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備

2010年度   植物ゲノム比較データベースSALAD databaseとマイクロアレイデータビュワーSALAD on ARRAYs

2010年度   データの積算によるmRNA-seqの網羅性の評価

2010年度   次世代型シーケンサーを用いたリン酸欠乏応答にかかわるイネのトランスクリプトーム解析

2010年度   アフリカ栽培イネ(Oryza glaberrima)のゲノム配列決定

2010年度   イネ属近縁種の比較ゲノム進化解析

2010年度   イネの次世代シーケンシングから見る多様性

2010年度   アジアの野生及び栽培イネの進化における不完全遺伝子分岐、種間交雑、遺伝子欠失の解析

2009年度   超高速シーケンサーを活用したイネのトランスクリプトーム解析

2009年度   高速シーケンサーによる全mRNAの配列決定と遺伝子予測

2009年度   解けない分子系統樹を決める~近縁種系統関係推定への挑戦

2009年度   次世代シーケンサーを活用したイネトランスクリプトーム解析パイプラインの開発

2009年度   IRGSP/RAP build 5アノテーションとRAP-DB新規機能

2009年度   イネアノテーション計画データベース(RAP-DB)

2008年度   イネゲノムの情報基盤構築と活用

2008年度   イネゲノムの情報基盤整備と比較ゲノム解析

2008年度   栽培イネと野生イネの比較ゲノム解析で明らかになった栽培イネのゲノム進化

2008年度   植物の転写開始点に見られる種間保存性と相対位置による多様性

2008年度   Diversified evolution of downstream transcription start sites in Oryza and Arabidopsis thaliana

2007年度   イネアノテーションデータベース(RAP-DB)

2007年度   H-InvDB Evolaにおけるヒト遺伝子のオルソログ解析

2007年度   Evola: 系統樹解析にもとづくH-InvDBヒト遺伝子のオルソログデータベース

2007年度   G-compass: ヒトとモデル生物種間の比較ゲノムブラウザー

2006年度   醸造用オオムギはるな二条(Hordeum Vulgare cv. Haruna Nijo)の新規な完全長cDNAライブラリーの構築

2006年度   醸造用オオムギ「はるな二条」(Hordeum vulgare cv. Haruna Nijo)発現遺伝子の網羅的解析を目指した新規完全長cDNAライブラリーの構築

2006年度   比較ゲノム解析による栽培イネと野生イネの系統関係の解明

2005年度   脊椎動物特異的なゲノム構造進化の発見

2004年度   比較ゲノム(進化)微生物のゲノム進化解析

2004年度   水平遺伝子移行とその進化的意味

2004年度   微生物の水平移行遺伝子における自然選択

2001年度   稲発酵粗飼料不断給餌による泌乳牛飼養法の検討

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